2.2 derse19 2019-06-04 2019-06-06 3 00:05 2019-06-04T09:00:00+02:00 09:00 01:30 Haus H: Hörsaal derse19-172-derse19-morning-run https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/Y8DGV7 true Social Event en None deRSE19 Joggers: Join us for a morning run along a route through beautiful Potsdam. We meet in **Building A17, at the library** Kaja Scheliga 2019-06-04T13:15:00+02:00 13:15 00:10 Haus H: Hörsaal derse19-150-welcome-to-derse19 https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/BUKLJF false Keynotes Grußwort (10 Min) en None Welcome to deRSE19! deRSE19 Organizers 2019-06-04T13:25:00+02:00 13:25 00:10 Haus H: Hörsaal derse19-151-derse19-de-rse-e-v-society-for-research-software https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/M9JJH7 false Keynotes Grußwort (10 Min) en None Welcome to deRSE19 from the Programme Committee and de-RSE e.V. - Society for Research Software de-RSE e.V. - Society for Resarch Software & deRSE19 Programme Committee 2019-06-04T13:35:00+02:00 13:35 00:10 Haus H: Hörsaal derse19-152-welcome-from-the-gesellschaft-fr-informatik-gi- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/3ZBVAN false Keynotes Grußwort (10 Min) en None tba Prof. Dr. Michael Goedicke 2019-06-04T13:45:00+02:00 13:45 00:05 Haus H: Hörsaal derse19-153-welcome-from-awi https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/DXV7GX false Keynotes Grußwort en None tba Prof. Dr. Bernhard Diekmann 2019-06-04T13:50:00+02:00 13:50 00:05 Haus H: Hörsaal derse19-154-welcome-from-pik https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/GVZRZB false Keynotes Grußwort en None tba Dr. Elmar Kriegler 2019-06-04T13:55:00+02:00 13:55 00:05 Haus H: Hörsaal derse19-155-welcome-from-gfz https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/EZZGWC false Keynotes Grußwort en None tba Martin Hammitzsch 2019-06-04T14:00:00+02:00 14:00 00:45 Haus H: Hörsaal derse19-138-keynote-rses-together-building-networks-groups-organisations-and-careers https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/ZD3B3K false Keynotes Keynote (45 Min) en None RSEs are at the forefront of a cultural change as organisations adjust to the opportunities and challenges of modern, computational research. One RSE can make a big difference to a project but being part of groups and communities of software specialists can empower them to have a greater impact and a more satisfying career. In this talk Alys Brett, the chair of the Society for Research Software Engineering, will share the experience from the UK of building recognition for the RSE role and developing groups, career structures and communities, and now a professional society. Alys Brett 2019-06-04T14:45:00+02:00 14:45 00:45 Haus H: Hörsaal derse19-140-keynote-building-a-future-with-ai https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/PCQSRY false Keynotes Keynote (45 Min) en None In this Keynote Sven Wildermann and Bradley Tipp will be presenting Microsoft’s vision on AI. They will elaborate on which research milestones and tipping points have been reached - and which cognitive services are already available for developers today. And touching upon one of the key challenges for AI, Microsoft’s experts will showcase how “AI for All” is happening already, making artificial intelligence work for everyone. Sven WildermannBradley Tipp 2019-06-04T16:00:00+02:00 16:00 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-94-challenges-for-verifying-and-validating-scientific-software-in-computational-materials-science https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/VYX8TW false Testing Research Software (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None Many fields of science rely on software systems to answer different research questions. For valid results, researcher need to trust the results that scientific software produces. Consequently, quality assurance is of upmost importance. In this talk, we are investigating the impact of quality assurance in the domain of computational materials science (CMS). Based on our experience in this domain, we formulate four challenges for validation and verification for scientific software and their results: lack of precise oracles, large configuration spaces, large-scale and heterogeneous data, and global software development. Furthermore, we describe directions for future research that can potentially help on dealing with these challenges. Thomas VogelLars GrunskeStephan Druskat 2019-06-04T16:30:00+02:00 16:30 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-38-the-quest-for-better-tests-in-scientific-computing https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/MNQFUV false Testing Research Software (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None Writing tests for scientific computing software is very hard. The input space for programs can be infinite, therefore selecting "good" or "interesting" inputs is crucial. Time and computing resources to execute tests however are limited, but developers need timely responses to changes. Guidelines to implement tests under these, and likely more, constraints are not readily available in literature. This contribution tells the story of trying to move our Python library pyMOR to property based testing, simplifying the process of writing more meaningful tests with less code and balancing runtime versus impact. We also include a call to action for the community to jointly develop concrete guidelines for designing and implementing unit tests. René Fritze 2019-06-04T17:00:00+02:00 17:00 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-115-decentralized-software-development-facilitating-ci-cd-to-produce-high-quality-open-source-code-in-a-european-metrological-joint-research-project https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/TZFTBE false Testing Research Software (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None Physikalisch-Technische Bundesanstalt coordinates the joint research project EMPIR 17IND12 "Metrology for the factory of the future" with 15 partner institutions spread all over Europe working together with around 30 international industry partners on topics around sensor networks in industry 4.0 settings. This involves a lot of collaborative coding in a publicly hosted GitHub repository with a fully enabled CI/CD pipeline. The talk guides through the whole setup process for the central repository, collecting all the code written in and for the project, configuration of the chosen CI/CD tools and the experiences with implementing associated software development workflows in the context of such a heterogeneous research environment. Björn Ludwig 2019-06-04T18:00:00+02:00 18:00 00:25 Haus H: Hörsaal derse19-41-the-art-of-giving-and-receiving-code-reviews https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/TF8EKE false Software Quality Management (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None Code reviews are an invaluable tool for improving code quality - not just by catching bugs, but also by improving readability, scalability and maintainability of code. But code reviews are challenging to do effectively, for reasons of personal psychology as well as organisational structure and culture. This talk will present tactics for constructive code review drawing on conflict resolution theory and lessons from the software industry, and discuss the particular challenges of applying these in a research setting. Alex Hill 2019-06-04T18:25:00+02:00 18:25 00:25 Haus H: Hörsaal derse19-35-develop-license-test-curate-mathematical-optimization-in-the-real-world https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/MDKJ9D false Software Quality Management (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None SCIP is a solver for mathematical optimization problems developed at the Zuse Institute Berlin (scip.zib.de). It is openly available for academic use and widely employed in research and education at many institutes and universities around the world. For commercial use, a license fee is charged. The source code is version controlled with git, while a continuous integration and regular tests ensure correctness. Theoretical ideas developed in theses and research articles are implemented in SCIP to analyse their impact on functionality and performance. Two Python tools were developed for this analysis. In this talk we want to introduce both SCIP and these tools with a focus on their interaction and the development process. Franziska SchlösserMatthias Miltenberger 2019-06-04T18:50:00+02:00 18:50 00:25 Haus H: Hörsaal derse19-91-gitlab-pipelines-for-every-need-testing-documentation-and-writing-a-paper https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/KVREQV false Software Quality Management (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None Continuous integration/delivery (CI/CD) pipelines are easily available: it's bundled with GitLab, for example. They can be used for various purposes: automatically testing a codebase on every commit, building and deploying a package and many more. Using CI/CD pipelines have greatly improved workflows in a few of my projects. Based on these experiences, I would demonstrate a few use cases for CI/CD pipelines: (a) automated unittesting in a python software project, (b) scheduled integration tests, (c) automatically generating PDF manuscripts from LaTeX source. Debsankha Manik 2019-06-04T16:00:00+02:00 16:00 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-75-lebensverlngernde-manahmen-fr-fortran-codes https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/VPPA77 false Sustainable long-living Software I (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None In der Forschung ist Fortran noch an vielen Stellen anzutreffen. Insbesondere auf Höchstleistungsrechnern ist es nicht wegzudenken. Aber auch moderne Programmiersprachen wie Python erfreuen sich großer Beliebtheit in der Forschung. Damit bewährte Implementierungen nicht neu geschrieben werden müssen, kommt immer häufger ein Mix aus Programmiersprachen zur Anwendung. Das Programm F2x unterstützt dabei, in Fortran geschriebene Software aus anderen Programmiersprachen zugängliche zu machen. Dieser Vortrag versucht den Leidensdruck darzustellen, der schließlich zur Entwicklung von F2x geführt hat, warum das Werkzeug seine heutige Form hat und warum es Spaß macht mit und für Wissenschaftler*innen Software zu entwickeln. Michael Meinel 2019-06-04T16:30:00+02:00 16:30 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-76-entwicklung-der-forschungssoftware-rce-im-dlr https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/GXSUFU false Sustainable long-living Software I (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None RCE (Remote Component Environment) ist eine verteilte Integrationsumgebung, die im DLR entwickelt und von Forschern innerhalb und außerhalb des DLR genutzt wird. RCE ermöglicht das Einbinden und Freigeben von Simulationswerkzeugen, die über ein Netzwerk gemeinsam genutzt und zu automatisierten Workflows kombiniert werden können. Ein typisches Anwendungsgebiet ist hierbei die multidisziplinäre Optimierung z.B. von Flugzeugentwürfen. RCE ist Open Source und wird in Forschungsprojekten in Zusammenarbeit mit Nutzern weiterentwickelt. In diesem Vortrag zeigen wir, wie wir RCE im Team entwickeln und welche besonderen Herausforderungen die Entwicklung einer Produktivsoftware im Forschungskontext mit sich bringt. Brigitte BodenRobert Mischke 2019-06-04T17:00:00+02:00 17:00 00:25 Haus A56: Konferenzsaal derse19-97-softwareentwicklung-zwischen-forschungscode-und-industriereleases https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/UFWKT3 false Sustainable long-living Software I (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Im GasLab werden Algorithmen entwickelt, um in Gasnetzwerken Flüsse vorherzusagen und Empfehlungen zur Steuerung von Kompressorstationen zu berechnen. Unser Team besteht aus vier EntwicklerInnen und Admins, die die Tools und Infrastruktur für elf Mathematik-ForscherInnen bereitstellen und betreiben um aus Forschungscode stabile Releases für unseren Industriepartner zu entwickeln. Wir kämpfen mit ständig wechselnden Datenformaten, Dateninhalten, Projektzielen und Deliverables. Die Releaseprozesse sind wegen der Sicherheitsaspekte des Gastransportunternehmens langwierig und erfordern mehrere Test- und Reportphasen. Wir wollen unsere Erfahrungen mit verschiedenen Arbeitsabläufen und Tools teilen: Was hilft Releases stabil zu halten? Julia Kern 2019-06-04T18:00:00+02:00 18:00 00:25 Haus A56: Konferenzsaal derse19-3-die-hard-1-1024-0-backward-compatibility-of-a-search-engine-with-persistant-ids https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/78JDY7 false Sustainable long-living Software II (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None Semantic versioning can be used to describe the downward compatibility of software. Using the example of a search engine for linguistic annotations, we show which problems can occur when operating a search-based service with persistent IDs for queries and results and present possible solutions. Different components, such as the software, the domain-specific query language, and the web service, provide different guarantees and make different demands on downward compatibility. By migrating an existing PostgreSQL-based system to our own implementation, we gain important practical experience in the downward-compatible modernization of an existing system, which we will share in this talk. Thomas KrauseStephan Druskat 2019-06-04T18:25:00+02:00 18:25 00:25 Haus A56: Konferenzsaal derse19-61-challenges-and-opportunities-of-open-source-software-the-case-of-su2 https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/FAKFHV false Sustainable long-living Software II (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None The open-source SU2 suite has grown in just a few years from a small tool for aerodynamic design to a large community of users and developers with an interest in multidisciplinary optimization. Open collaboration in SU2 has boosted the research of a large number of groups across the world, independently of whether they are directly involved in its development or not. As an example, the original 2013 AIAA conference paper has already received more than 250 citations. However, as the code grows and incorporates new features, so do the challenges related to its management, maintenance and code architecture. This talk will discuss the main challenges of open-source governance on a rapidly growing framework like SU2. Ruben Sanchez 2019-06-04T18:50:00+02:00 18:50 00:25 Haus A56: Konferenzsaal derse19-124-new-approaches-towards-user-research-and-software-architecture-in-research-software-engineering-a-humanities-example https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/YKUSYM false Sustainable long-living Software II (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None The "Census of Antique Works of Art and Architecture Known in the Renaissance" is a research database containing cultural heritage information. Currently, we are working towards a reconception of the "Census" and face the following two challenges. First, we know very little about the Census users' behavior. Second, it is necessary to steer towards a paradigm shift regarding the software architecture design of the current Census web application. In our talk we would like to present our findings and thoughts about user research in Digital Humanities (esp. focussing on art history) and discuss an approach to modular and sustainable software architecture for object- and image database application in the Digital Humanities. Oliver Pohl, Andrea Notroff 2019-06-04T16:00:00+02:00 16:00 00:25 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-36-building-research-software-communities https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/KWUFQW false Community Building (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None Even where institutions have a central research software team, there is still scope for software development work to be undertaken by researchers/developers in individual research groups. Research software communities are a great way to support a "grass roots" base of researchers and developers building software, helping them enhance their skills, network with peers and build new collaborations. In this talk I'll provide my perspective on the benefits of research software communities and look at examples of building a UK-based local, institutional community and a wider regional community. Through these examples, I'll look at challenges faced in starting and sustaining such communities and highlight some of the key benefits they can offer. Jeremy Cohen 2019-06-04T16:25:00+02:00 16:25 00:20 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-74-building-scientific-communities-lessons-learned-with-airr https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/D7DCP8 false Community Building (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None AIRR-seq (Adaptive Immune Receptor Repertoire sequencing) data is a special subtype of genome sequencing data, which is assumed to be representative of an individual's immune status and therefore holds large promises for biomedical research. The AIRR Community was founded in 2015 with the goal to foster the exchange of AIRR-seq data by making it FAIR and available under free/open licenses. It is an international group that assembles researchers and practitioners from all disciplines involved in generating, processing and interpreting this data: Biology, informatics, data science, medicine and law. In this talk I will summarize the main lessons we learned in the process of establishing the community and setting and reaching its goals. Christian Busse 2019-06-04T16:45:00+02:00 16:45 00:20 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-101-building-a-healthy-and-vibrant-volunteer-driven-community-the-bio-it-project https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/MMLFWX false Community Building (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Bio-IT is a volunteer-driven community at the European Molecular Biology Laboratory (EMBL) whose aim is to develop the technical capacity of the local researchers and increase the quality of software developed at EMBL. It has grown into a community of volunteers who contribute by developing resources and disseminating computational skills. I have been an active member of Bio-IT for 3 years, in part because the work is fun, but mostly because of how the Bio-IT community has been built. I would like to share with you a community member’s view of the Bio-IT project, some of the successes and challenges faced in the past few years, and will also share a few community strategies adopted by Bio-IT to keep their members motivated and contributing. Marc Gouw 2019-06-04T17:05:00+02:00 17:05 00:25 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-117-help-me-help-you https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/RYQN3Y false Community Building (Sprache: Englisch) Talk (25 Min) en None One of the core tasks of Research Software Engineers is to support researchers to produce reproducible, sustainable, and robust research. This, in the long turn, can lead to higher impact and better utilization of resources. But how can we (the RSEs) actively engage with the academic community and build long-lasting relationships for the improvement of research? How can we convince the wider academic or research body about the importance of RSEs? In this talk, I will present a number of initiatives and approaches that have proved successful when building these RSEs-researchers and RSEs-department relationships for everyone’s benefit. Tania Allard 2019-06-04T18:00:00+02:00 18:00 00:25 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-18--hifis-software-services-das-competence-cluster-fr-eine-nachhaltige-softwareentwicklung-in-der-helmholtz-gemeinschaft https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/SVW9DD false Institutional RSE Communities I (Sprache: Deutsch) Talk (25 Min) de None Die HGF hat vier Plattformen gegründet, die gemeinsam das neue Helmholtz Information & Data Science Framework bilden. HIFIS, eine der neuen Plattformen, installiert hierfür drei Kompetenzcluster, um Cloud-, Backbone- und Software-Services anzubieten. Ziel des Kompetenz-Clusters für Software Services ist die Unterstützung von Mitarbeitern der Helmholtz-Zentren, die Forschungssoftware entwickeln. Trainings, Workshops, Hackathons und Online-Kurse, die Bereitstellung einer Infrastruktur für die Softwareentwicklung, Support sowie ein Netzwerk für Communities sollen angeboten werden, um der Bedeutung nachhaltiger Softwareentwicklung im Forschungsprozess gerecht zu werden. Der Vortrag informiert über Erfahrungen, Lösungsansätze und Aktivitäten. Uwe Konrad 2019-06-04T18:25:00+02:00 18:25 00:25 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-112-rahmenbedingungen-fr-einen-nachhaltigen-umgang-mit-forschungssoftware-am-helmholtz-zentrum-potsdam-deutsches-geoforschungszentrum-gfz https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/K9JEM7 false Institutional RSE Communities I (Sprache: Deutsch) Talk (25 Min) de None Am Helmholtz-Zentrum Potsdam - Deutsches GeoForschungsZentrum GFZ befasst sich der Arbeitskreis "Softwareentwicklung am GFZ" mit der Erarbeitung von Leitlinien und Hilfestellungen für Software entwickelnde MitarbeiterInnen und kümmert sich um die Etablierung eines offenen Prozesses für einen nachhaltigen Umgang mit Forschungssoftware. Neben der Erarbeitung eines einheitlichen Prozess für die Weitergabe und Zugänglichmachung von Software wird auch an einer Hilfestellung zur Anwendung und Umsetzung von Best Practices bei der Softwareentwicklung, Lizenz- und Verwertungsstrategien für Software und einem Leitfaden für die Publikation von Software gearbeitet. In dem Vortrag sollen die Arbeit und Ergebnisse des Arbeitskreises vorgestellt werden. Martin Hammitzsch 2019-06-04T18:50:00+02:00 18:50 00:25 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-125-eine-virtuelle-werkstatt-fr-die-digitalisierung-in-den-wissenschaften https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/FMHV8M false Institutional RSE Communities I (Sprache: Deutsch) Talk (25 Min) de None Die Friedrich-Schiller-Universität Jena hat 2019 am Michael Stifel Zentrum eine Werkstatt für Digitalisierung in den Wissenschaften eingerichtet. Hier arbeiten Wissenschaftler/-innen aus der Informatik und aus unterschiedlichen Anwendungsdisziplinen im Bereich des maschinellen Lernens und der semantischen Methoden zusammen und tauschen sich regelmäßig auch zu gemeinsamen RSE-Themen aus. Neben der Vorstellung, wie diese ausnahmsweise nicht-grassroots RSE-Umgebung funktioniert, werden Ansätze gezeigt, diese projektorientierte Gruppe von RSEs mit anderen RSEs an lokalen Wissenschaftsinstitutionen und innerhalb der deRSE zu vernetzen. Damit soll eine Diskussion über den Aufbau und die Vernetzung von RSE-Gruppen angestoßen werden. Frank Löffler 2019-06-04T16:00:00+02:00 16:00 01:30 Haus A31: Große Kuppel derse19-95-jupyter-interactive-visualizations-in-python-and-c- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/FSP7QH false Workshops Workshop en None Project Jupyter has gained steady adoption for interactive computation and visualization in the context of Data Science and Machine Learning. During this workshop we will present - The Project Jupyter Notebook and the underlying protocol implementation - ipywidgets, the library that enables interactive widgets, from simple buttons & sliders to maps and 3D plots - xeus-cling, the interactive C++ kernel for the Jupyter ecosystem In the interactive part of the workshop we will walk through creating custom widgets for interactive data visualizations, and gain a deeper understanding of the traitlets protocol, which is used to synchronize data from C++ or Python to the JavaScript frontend. Wolf VollprechtJohan Mabille 2019-06-04T18:00:00+02:00 18:00 01:15 Haus A31: Große Kuppel derse19-25-agiles-software-engineering-fr-lokale-teams-mit-scrum-eine-einfhrung- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/8LC97B false Workshops Workshop (75 Min) de None Scrum ist ein Weg, um im Team Software agil zu erstellen. Das eigentliche Team steht dabei im Fokus und liefert kontinuierlich weiterentwickelte Versionen der Software ab. Durch den Daily Scrum wird der aktuelle Zustand der Software permanent transparent dargestellt. Weitere Maßnahmen wie die Sprint Planung und die Sprint Retrospektive verbessern die Vorhersagegüte des Teams. Dieser Workshop führt in alle beteiligten Rollen und Werkzeuge ein und befähigt die Methode grundlegend anzuwenden. Stephan JanoschCornelia AuerJan Dietrich 2019-06-04T16:00:00+02:00 16:00 01:30 Haus A45 Süd: Konferenzraum derse19-135-developing-for-the-cloud-azure-notebook-devops-cognitive-services-vm-and-databricks https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/WWMELC false Workshops Workshop en None In this workshop, Microsoft technology experts will showcase how Azure Notebook - based on Jupyter Notebooks - can be used to kick-start development in a cloud environment. In addition, we will demonstrate building a CI/CD pipeline using Azure DevOps, integrate AI into your own applications quickly and easily with Cognitive Services, and introduce DataScience VM and Azure DataBricks as a quick way to get into data science. Marcus Kunde 2019-06-04T18:00:00+02:00 18:00 01:15 Haus A45 Süd: Konferenzraum derse19-33-frauen-in-der-entwicklung-von-forschungssoftware https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/XAMSLD true Workshops Workshop (75 Min) de None Umfragen zeigen, dass die Entwicklung von Forschungssoftware derzeit ein stark männlich dominiertes Feld ist. Dabei gibt es viele Initiativen, um Mädchen für MINT-Fächer zu gewinnen und Frauen in der Wissenschaft zu fördern. Trotzdem widerspiegelt sich das noch nicht im Anteil der Frauen bei der Entwicklung von Forschungssoftware. Wir möchten deRSE19 dazu nutzen, um die Vielfalt in der Community zu stärken und in einem Workshop von Euren Erfahrungen zu hören. Wie erfahren Frauen ihre Rolle in den Softwareenwicklungsteams? Was wünschen sich Frauen, um auch längerfristig an diesem Thema arbeiten zu können? Was können wir aus den Erfahrungen und Herangehensweisen von erfolgreichen Softwareentwicklerinnen für andere nutzbar machen? Bernadette FritzschDagmar Krefting 2019-06-04T16:00:00+02:00 16:00 01:30 Haus A31: Westflügel derse19-99-libraries-the-brick-and-mortar-type-for-research-software-engineers https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/9XGBBH false Workshops Workshop en None Libraries have been supporting research for centuries. They help you find interesting information, provide trainings, help you publish your research and archive most of it. Librarians are specialists in information indexing, resource descriptions and metadata management. In sum, libraries act as generalists who support the specialists. This workshops will connect librarians and RSEs in order to tackle current problems in research software discovery, training, archiving and publishing. We will show where libraries are already supporting research software and its developers and identify future work. Alexander Struck, Ronny Gey, Katrin Leinweber, Robert Strötgen, Christian PietschChristian PietschAlexander StruckRobert StrötgenKatrin Leinweber 2019-06-04T18:00:00+02:00 18:00 01:15 Haus A31: Westflügel derse19-119-restructuring-scientific-software-using-semantic-patching-with-coccinelle https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/URQ7X3 true Workshops Workshop (75 Min) en None Maintenance of a large HPC software in C/C++ can be demanding. Factors like evolving 3rd-party APIs and hardware require significant efforts to project sustainability. Failure in coping with these challenges can lead to obsolescence, performance loss, vendor lock-in, bugs. This workshop introduces the `Coccinelle' tool for semantics-aware matching and patching of C code. While initially conceived for automatically keeping up-to-date Linux kernel drivers, Coccinelle has been underexplored in other contexts. Here, emphasis will be given on code restructuring for High Performance Computing (HPC) codes in support to domain scientists. Coccinelle can also be a powerful testing tool. Discussion and experience exchange is welcome. Michele Martone 2019-06-04T09:00:00+02:00 09:00 02:00 Haus H: Foyer derse19-171-volunteers-briefing https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/DQRFYK false Organisatorisches Treffen en None Frederieke Miesner 2019-06-04T11:30:00+02:00 11:30 00:45 Haus H: Foyer derse19-173-guided-tour-telegrafenberg https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/T3J3WS false Social Event en None deRSE19 Organizers 2019-06-04T12:00:00+02:00 12:00 01:15 Haus H: Foyer derse19-160-registration-lunch https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/NYT7YH false Pause en None deRSE19 Organizers 2019-06-04T15:30:00+02:00 15:30 00:30 Haus H: Foyer derse19-161-coffee-break https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/REETJX false Pause en None Coffee Break deRSE19 Organizers 2019-06-04T17:30:00+02:00 17:30 00:30 Haus H: Foyer derse19-162-coffee-break https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/LQMCRD false Pause en None Coffee Break deRSE19 Organizers 2019-06-04T19:30:00+02:00 19:30 02:00 Haus H: Foyer derse19-148-conference-dinner https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/3MJHRY false Abendessen Konferenzdinner en None Sponsored by Microsoft Deutschland GmbH. deRSE19 Organizers 2019-06-05T11:00:00+02:00 11:00 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-120-optimizing-developer-productivity-in-endangered-language-documentation-apps https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/NFAVXV false Software Engineering Productivity (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None Most of the world's languages will cease to be spoken by 2100, many before they are recorded. Domain-specific application software has the potential to allow more languages to be recorded, but most linguists continue to use generic tools like paper or spreadsheets instead of apps. I will argue that users don't use these apps because their quality is not good enough, and that their quality is not good enough because of the severe shortage of development labor in the space of language documentation. I will then present an experimental app I created to investigate whether choice in programming tools (libraries, platform, etc.) could dramatically increase developer productivity, and therefore enable the creation of an app linguists would use. Luke Gessler 2019-06-05T11:30:00+02:00 11:30 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-105-ediarum-from-bottom-up-to-generic-programming https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/NKP9AH false Software Engineering Productivity (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None With ediarum, the TELOTA group of the Berlin-Brandenburg Academy of Sciences and Humanities has been developing a working and publication environment for digital scholarly editions for several years. In contrast to similar projects, a bottom-up approach was chosen, i.e. the research environment was developed for the needs of individual scholarly editions projects. Due to the success of the research software, ediarum is used for more and more editions. This led to the change of the development model to a generic approach. The advantages and disadvantages of the development approaches and the organizational structure are discussed in the article. Martin FechnerStefan Dumont 2019-06-05T12:00:00+02:00 12:00 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-57-debian-astro-a-debian-pure-blend-for-astronomy-and-astrophysics https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/JSCVWP false Software Engineering Productivity (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None Debian Astro is a way to improve the ecosystem of astronomical software. Astronomical software with appropriate licenses is packaged and distributed together with all necessary dependencies as an integral part of the Debian distribution. Debian GNU/Linux is an open distribution with an open development model and a standardized build and installation process. This ensures high stability and reliability of the software as well as reproducibility, which is important in a scientific environment. Continious integration and regular testing on various platforms help to maintain a high quality of the software packages. Ole Streicher 2019-06-05T13:30:00+02:00 13:30 00:18 Haus H: Hörsaal derse19-15-automated-deadline-based-scaling-of-experiments-in-the-cloud-with-micado https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/3N7FJP false Working Session: Research Software Frameworks (Sprache: Englisch) Talk (18 Min) en None Many scientific applications require computation resources based on dynamically changing requirements. The H2020 COLA (project-cola.eu) set out to solve this with a generic framework (MiCADO) to support automated scalability of applications deployed to the cloud. MiCADO is open-source, cloud agnostic and uses widely applied technologies - Kubernetes, Occopus and Prometheus - to scale virtual machines and containers in the cloud. MiCADO has been tested on a range of small to large-scale research activities that saw simulations and other multi-job experiments queued, executed and scaled in containers on different public and private clouds. The talk will focus on MiCADO, its architecture, characteristics, and its benefits to the RSE community. James DesLauriers 2019-06-05T13:45:00+02:00 13:45 00:18 Haus H: Hörsaal derse19-49-parallel-in-time-integration-with-pfasst-from-prototyping-to-applications https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/AAVTZY false Working Session: Research Software Frameworks (Sprache: Englisch) Talk (18 Min) en None The efficient use of modern supercomputers has become one of the key challenges in computational science. For the numerical solution of time-dependent processes, time-parallel methods have opened new ways to overcome scaling limits. With the “parallel full approximation scheme in space and time” (PFASST), multiple time-steps can be integrated simultaneously. Since its use within an existing application code is not straightforward and the potential gain is typically uncertain, we will present in this talk our Python prototyping framework pySDC. It allows to rapidly test new ideas and to implement first toy problems more easily. We will also discuss the transition from pySDC to application-specific implementations. Robert Speck 2019-06-05T14:00:00+02:00 14:00 00:18 Haus H: Hörsaal derse19-2-software-for-autonomous-astronomical-observatories https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/ETRNMR false Working Session: Research Software Frameworks (Sprache: Englisch) Talk (18 Min) en None For long, autonomous astronomical telescopes have been the dream of all observing astrophysicists. Partly realized in space missions, the era of robotic observatories as now begun even for ground-based facilities, where the variety of (unpredictable) environmental conditions has long impeded success. The AIP is one of the few institutes world-wide to operate 1-m class telescopes in fully autonomous mode. In this talk, I will focus on the software framework developed throughout more than 15 years to pursue this endeavor. Thomas Granzer 2019-06-05T14:15:00+02:00 14:15 00:18 Haus H: Hörsaal derse19-93-xtensor-a-n-dimensional-container-for-c- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/RHRXEM false Working Session: Research Software Frameworks (Sprache: Englisch) Talk (18 Min) en None The backbone of High Performance Computing and Data Science are array computing libraries. This talk will present xtensor, an attempt to create a universal nD-container and array-computing library in C++. xtensor is a lightweight and modular framework that follows the idioms of the STL while providing an API that draws heavy inspiration from the widely used NumPy package. The library allows to operate in-place on data structures from Python, R and Julia. It is therefore an ideal library to write interpreter independent science packages. We will also discuss our usage of xsimd, a standalone library for explicit SIMD parallelization that is used to achieve high performance with xtensor. Wolf VollprechtJohan Mabille 2019-06-05T14:30:00+02:00 14:30 00:18 Haus H: Hörsaal derse19-12-generation-of-a-wrapper-library-for-mpi-medipack https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/CBYUMJ false Working Session: Research Software Frameworks (Sprache: Englisch) Talk (18 Min) en None The wrapping of libraries like MPI requires an approach that is flexible in multiple aspects. Changes and additions to the library, updates to the wrapper logic, and bugfixes need to be handled. Problems will arise if the wrapper is hard coded: any required change to the wrapping logic would affect the whole implementation. The maintenance of such an approach is usually not feasible. The approach for in the code is to write a code generator. Changes to the wrapper logic only need to be made at one place and additions to the wrapped library can either be handled automatically or by updating a definition file. This talk will show the challenges of writing the generator, the tools used for the generation and the reasons why a wrapper is requi Max Sagebaum 2019-06-05T15:30:00+02:00 15:30 00:20 Haus H: Hörsaal derse19-90-insight-earth-system-models https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/WDLWEB false Working Session: Experience with Simulation Software (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None This is a story about a research software engineer within the PalMod (German Climate Modeling Initiative) project. Its aim is to carry out a long-term high-resolution simulation run of the last glacial cycle (from 120 000 years before now until today). The designated model is the Max Planck Institute for Meteorology Earth System Model (MPI-ESM), which consists of about 900 000 lines of code and has been developed over decades. The story told is less a scientifc talk, more an up-to-date peek into the machinery behind a grand scientific operational model. It is about the lessons learned during a interdisciplinary work between result oriented software usage and sustainable software development. Jaroslaw Piwonski 2019-06-05T15:50:00+02:00 15:50 00:20 Haus H: Hörsaal derse19-16-palm-a-story-of-developing-and-maintaining-a-scientific-model-system https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/PX89AP false Working Session: Experience with Simulation Software (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None PALM is an advanced and modern meteorological model system for atmospheric and oceanic boundary-layer flows. It has been developed as a turbulence-resolving large-eddy simulation (LES) model that is especially designed for performing on massively parallel computer architectures including GPUs. Within our talk we give a short introduction to the model system PALM and give an overview on how we manage to develop and maintain the software. This includes a view on how we do source-code management, automated testing, and code documentation. We also give information on the many problems and difficulties which arise when working on an ever-growing software package with a team originally not based within the field of computer science. Tobias Gronemeier 2019-06-05T16:10:00+02:00 16:10 00:20 Haus H: Hörsaal derse19-108-how-to-build-a-modern-particle-based-cfd-framework-for-both-industry-and-science https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/PGKUVS true Working Session: Experience with Simulation Software (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Applying fluid flow simulations to problems of industrial scale is a challenging task. To tackle this, an own CFD code based on Smoothed Particle Hydrodynamics arose in a research cooperation between universities and industrial partners. In 2017 the spin-off dive solutions GmbH emerged. The software includes the physical treatment of free surface and multiphase flow, adaptive resolution, a non-particle boundary condition and OMP/MPI parallelization for both on and off premise systems. A python wrapping enables scientists to solve their problems on a higher-level interface and encapsulates the algorithms from the users. The talk presents the described constellation, the software framework as well as the challenges within Lagrangian CFD. Markus TaeschSabine Przybilla 2019-06-05T16:30:00+02:00 16:30 00:20 Haus H: Hörsaal derse19-54-esm-tools-a-software-tool-for-earth-system-modelling-scientists https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/9GHU9G true Working Session: Experience with Simulation Software (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Earth system modelling is a key instrument to investigate the climate system. This includes the simulation of processes on a large range of scales and of different Earth system components. To account for the different components, Earth System Models (ESM) are composed of submodels. In practice, these submodels are developed independently and bring their own scripts for downloading, compiling and execution. In order to bundle these various scripts in one tool, we developed the ESM-TOOLS software. The aim is to facilitate the work with different ESM and, therefore, to ease the work of the Earth system scientist. We will briefly explain the purpose of the ESM-TOOLS, and discuss our experiences during development and application by the users. Nadine Wieters 2019-06-05T17:15:00+02:00 17:15 01:00 Haus H: Hörsaal derse19-137-poster-lightning-talks https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/H9RMNX false Poster Poster Lightning Talks en None tba Bernadette Fritzsch 2019-06-05T09:00:00+02:00 09:00 00:05 Haus A56: Konferenzsaal derse19-144-welcome-day-2 https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/D8AWG8 true Keynotes Welcome en None tba deRSE19 Organizers 2019-06-05T09:05:00+02:00 09:05 00:45 Haus A56: Konferenzsaal derse19-139-keynote-sustainable-research-software-as-code-as-paper-as-book https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/ZCYXEM false Keynotes Keynote (45 Min) en None How can I make research software sustainable? Five basic rules from Software Engineering and Open Source development have the biggest effect: Use a repository, build automatically, test extensively, allow for extension, use examples. The biggest breakthrough, however, comes with modern environments such as Jupyter Notebooks, which integrate code, description, examples, and results in one single document. In this talk, I present the basic rules for sustainable software and show using our textbook "Generating Software Tests" ([www.fuzzingbook.org](www.fuzzingbook.org)), how software, documentation, textbook and slides fit in a single comprehensive package. Andreas Zeller 2019-06-05T09:50:00+02:00 09:50 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-141-keynote-delivering-on-the-promise-of-research-computing https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/CQ7KEC false Keynotes Keynote (30 Min) en None The promise of the super-computing industry has always been that pioneering bleeding-edge technology built for the hyperscale filters down to become mainstream so we all have exciting stories about how the phone in your pocket is as powerful as the world’s fastest machine from not-so-many years ago. Whilst this is (was?) true for hardware, there are very few scientists who’ll tell you that software ease of use or accessibility has moved in such leaps and bounds. Moreover, whilst collaboration with others around the globe brings a lot of benefits, other factors like data security and privacy that can frequently – and very suddenly – demand lots of attention. If we’re to keep our pace of scientific discovery going (or even accelerate it), our most pressing task in the computing community is to give working scientists access to the tools & techniques they need in a form that’s easy to use, secure for their data and scalable to the limits of their ideas – not limited by their laptop’s memory capacity. This means an inherently different approach to what has come before, not just business as usual with more bandwidth. Brendan Bouffler 2019-06-05T10:20:00+02:00 10:20 00:15 Haus A56: Konferenzsaal derse19-164-conference-photo https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/Q7ALSB false Pause en None We are gathering at the A56 Conference Room to take the official conference photo. Say "deRSEEEEEE"! deRSE19 Organizers 2019-06-05T11:00:00+02:00 11:00 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-131-curious-containers-framework-zur-reproduzierbarkeit-von-digitalen-experimenten https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/7LLTCN false Reproducibility I (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Wir stellen unser Framework zur Reproduzierbarkeit von digitalen Experimenten vor - also wie kann man eine Analyse = "Code, Daten und Ausführungsumgebung" so beschreiben, dass man sie hinterher einfach replizieren kann. Wir haben dazu ein auf der Common Workflow Language basierendes Beschreibungsformat (Reproducible Experiment Description) entwickelt und die dazugehörigen Execution-Engines - ein CLI-Tool für die lokale Ausführung und eine Clustervariante. Und dazu einen Veröffentlichungsprozess von Sourcecode-Releases über eine Container-Appliance bis zum Experiment. (https://www.curious-containers.cc/) Dagmar KreftingChristoph Jansen 2019-06-05T11:30:00+02:00 11:30 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-45-portable-container-zum-entwickeln-erstellen-verteilen-und-ausfhren-von-komplexer-wissenschaftlicher-software https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/EKPHXX false Reproducibility I (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Komplexe wissenschaftliche Software zu konfigurieren und zu Erstellen kann eine herausfordernde Aufgabe aufgrund von zahlreicher Abhängigkeiten zu anderen Software-Bibliotheken oder -Tools sein. Reproduzierbare Simulationsläufe auf verschiedenen Plattformen gestaltet sich ebenfalls schwierig, da alle Abhängigkeiten im Vorfeld ebenso reproduziert werden müssen. Um diese Schwierigkeiten zu umgehen und reproduzierbare Wissenschaft zu erleichtern, können Container-Technologien als leichtgewichtige Alternative zu Computer-Virtualisierung eingesetzt werden. Am Beispiel der FEM-Simulations-Software [OpenGeoSys](https://www.opengeosys.org) wird in diesem Vortrag gezeigt, wie Container-Technologien (Singularity und Docker) eingesetzt werden können, um eine komplexe wissenschaftliche Software zu konfigurieren und zu erstellen und um sie schlussendlich portabel auf verschiedensten System (auch im High-Performance-Computing-Bereich) einzusetzen. Lars Bilke 2019-06-05T12:00:00+02:00 12:00 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-23-integrierte-entwicklungs-und-publikationsumgebung-fr-forschungssoftware-und-daten-am-helmholtz-zentrum-dresden-rossendorf-hzdr- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/WQXWWR false Reproducibility I (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Mit dem Ziel den gesamten Lebenszyklus wissenschaftlicher Artikel, Forschungssoftware und Daten in Vereinbarkeit mit den FAIR-Prinzipien zu unterstützen, wurde am HZDR eine integrierte Entwicklungs- und Publikationsumgebung geschaffen. Insbesondere die Publikation von Forschungssoftware und Daten erfordert eine technische und organisatorische Infrastruktur. Oft ist auch ein intensiverer Wissensaustausch und die Unterstützung der Wissenschaftler notwendig. Die Hürde zur Veröffentlichung sollte durch Automatisierung und Integration verschiedener Plattformen möglichst klein gehalten werden. In diesem Vortrag wird der aktuelle Stand, Erfahrungen und Herausforderungen gezeigt, die bei der Bereitstellung einer derartigen Umgebung gemacht wurden. Tobias Frust 2019-06-05T13:30:00+02:00 13:30 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-37-data-mining-made-easy-reproducible-and-open-source https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/7RWN7Y false Reproducibility II (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None The Challenge: Exponential increase in amounts of data from new microbial environments and non-model organisms requires “tailor-made” data mining solutions that are costly and frequently unavailable. The Vision: Simple data screening and analysis using a reproducible and easy to share open- source software environment. Shared interest of bioinformatic vision and microbiologist needs generated a generic visualization tool that can approach specific biological questions with the push of a button. We aim to present our project from the first steps of setting the needs and ideas to developed solutions and discuss our vision regarding scientific data analysis, review and publication. Alexander Bartholomäus 2019-06-05T14:00:00+02:00 14:00 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-47-reproducibility-of-particle-in-cell-simulations-in-plasma-physics https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/JPAVB9 true Reproducibility II (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None Particle-In-Cell (PIC) simulations are widely used to simulate the interaction of an ultra high intensity laser with a plasma. Although the underlying physics is the same in all cases, different codes will produce slightly different results. This is due to different numerical methods used to solve the differential equations describing the physics. Even when using the same PIC code in different versions, the results can differ, if the numerical methods or the implementation of certain features has been changed. In this talk, I will share the experiences I made with different PIC codes and propose a solution for open-source codes. Stefan Tietze 2019-06-05T14:30:00+02:00 14:30 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-111-common-workflow-language-cwl-based-software-pipeline-for-de-novo-genome-assembly-from-long-and-short-read-data https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/WB9Z9C true Reproducibility II (Sprache: Englisch) Talk (30 Min) en None For reliable gene prediction and post-genomic analyses, reference quality genome assemblies are essential. Here, we created an automated pipeline for the de novo-assembly of genomes from PacBio long-read and Illumina short-read data using common workflow language (CWL). This pipeline integrates and enables an automated installation and execution of a host of software tools, overcomes the challenges of achieving repeatability and reproducibility of assembly results, and offers a platform for the re-use of the workflow and the integration of diverse data sets. We achieved assemblies that meet the high standards set by the National Human Genome Research Institute (NHGRI), to underpin accurate gene predictions and expanded genomic analyses. Pasi Korhonen 2019-06-05T15:30:00+02:00 15:30 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-89-von-closed-zu-open-source https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/UJRJKT false Towards Open Research Software (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Aktuelle Softwareentwicklung findet häufig gemeinschaftlich und offen statt. Dies verbessert die Zuverlässigkeit und Akzeptanz der Software und erhöht die Sichtbarkeit der Entwickler. Während einige Forschungsgruppen von Beginn an Open Source entwickelt haben, beginnen andere gerade erst die Wichtigkeit dieses Themas zu erkennen. Oftmals wurde über viele Jahre hinweg an einer Software gearbeitet, die niemals zur Veröffentlichung gedacht war. Wenn nun solch ein Softwareprodukt Open Source gehen soll, stellt sich die Frage: Welche Schritte stehen an und welche Herausforderungen ergeben sich? Basierend auf unseren Erfahrungen präsentieren wir eine Schritt-für-Schritt-Anleitung für die notwendigen Schritte von Closed zu Open Source Software. Lavinia Baumstark 2019-06-05T16:00:00+02:00 16:00 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-55-forschungssoftware-als-digitale-ressource-erhalten https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/9REBTF false Towards Open Research Software (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Forschung führt oft zu Fortschritt, dies gilt auch für Forschungssoftware. Da Forschung meist direkt oder indirekt von öffentlichen Geldern finanziert wird, liegt es auf der Hand derart finanzierte Forschungssoftware unter freien Lizenzen zu veröffentlichen, damit alle an diesem Fortschritt partizipieren können. Diesen einfachen Grundsatz hat die Free Software Foundation Europe unter dem Slogan "Public Money? Public Code!" zusammen gefasst. Doch ist mit der Veröffentlichung alleine noch nicht der nachhaltige Fortbestand einer Software garantiert. Der Vortrag erörtert deshalb darauf aufbauend, wie sich ein nachhaltiges Wirtschaften und Konsum von Software und Ressourcenerhalt derselben gestalten lässt. Erik Albers 2019-06-05T16:30:00+02:00 16:30 00:30 Haus A56: Konferenzsaal derse19-51-neukonzeption-des-dlr-software-katalogs https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/7RPXZR false Towards Open Research Software (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Im DLR wird eine Vielzahl von Software entwickelt. Damit Software und ihr Beitrag zur Forschung sichtbar wird, existierten bereits verschiedene Ansätze für einen Software-Katalog im DLR. Bisherige Herausforderungen bestanden im Wartungsaufwand und in der Nutzer-Akzeptanz. In diesem Vortrag wird das aktuelle Konzept des Software-Katalogs vorgestellt. Durch die Entwicklung eines Prototyps sollen die bisherigen Schwachstellen gezielt adressiert werden. Dazu setzen wir auf Minimierung der Nutzereingabensowie automatische Ergänzung und Aktualisierung von Informationen. Diese Informationen werden in einer CodeMeta-Datei zusammengeführt. Auf dieser Basis werden die Software-Einträge für die Webseite des Software-Katalogs erstellt. Tobias Kolb 2019-06-05T11:00:00+02:00 11:00 00:20 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-104-evaluation-of-the-semantic-research-data-management-system-caosdb-in-glaciology https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/RXPHHP false Research Data Management (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None We evaluate the open source software CaosDB for its employment in glaciological ice-core research at the Alfred Wegener Institute in Bremerhaven. Here, the system is used for the logistical management of up to several kilometres long ice cores which are stored as ice-core sections in a freezer storage facility. We provided a loan work flow to facilitate and control the movement of ice samples during ice-core processing. Furthermore, we integrate data analysis algorithms for various processing procedures on the ice-core samples. The application of our research data management system (RDMS) to ice-core research demonstrates in particular how a flexible RDMS with a semantic data model can efficiently improve collaborative research. Alexander Schlemmer 2019-06-05T11:20:00+02:00 11:20 00:20 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-79-how-to-save-a-scientist-s-career-with-data-classes https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/3UTPZN false Research Data Management (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Imagine you have to withdraw your “Science” paper because you accidentally multiplied the wrong columns of your data. Experience shows that this scenario is not unlikely. Clever designed data classes could mitigate this risk. We present the prototype of an R data class targeted at increasing the reliability of data processing. The aim is to have a data class that features built-in consistency checks and meta-data handling without putting additional burden on the scientist. The current prototype keeps track of units and converts untis automatically, it prevents non-matching data from being combined, and it automatically generates meta-data during calculations allowing to inspect what kind of calculation has been performed on the data. David Klein 2019-06-05T11:40:00+02:00 11:40 00:20 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-20-linking-biological-data-using-data-science-and-cross-disciplinary-software-development https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/KAHXYP false Research Data Management (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None At the Netherlands eScience Center we contribute with 50+ domain- and computer scientists to an unusually broad range of scientific projects across all quantitative scientific domains. This triggers cross-disciplinary exchange, the strength of which will be illustrated by presenting an ongoing project on linking metabolomic and genetic data. Computational analysis of genomes can predict biosynthetic gene clusters (BGCs) responsible for producing complex biochemical compounds, many of which are still unknown. Adapting machine-learning tools from different domains, we develop a novel method aiming to pinpoint causal links between predicted BGCs and yet unidentified compound signals detected in rich metabolite mixtures. Florian Huber 2019-06-05T12:00:00+02:00 12:00 00:20 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-21-against-schematisation-mapping-the-choreographic-vector-space https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/ALTSUB false Research Data Management (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Documentation, archival and transmission of contemporary dance works and practices raises the question as to how and in what scope digitisation can already happen embedded in the creative process. To reach beyond performance as a seemingly tangible artwork, modes of digital capture must allow for embodied, intangible references and sub-processes to be put into context by practitioners and scholars. Bodies of work are thus being mapped to hyperlocal referential networks, discrete languages and ontological vector spaces. I present my work on mapping these networks and their unstructured artefacts through means of linked data and annotation as a "semantic glue" to facilitate navigation, inspection and manual as well as automated inference. Anton Koch 2019-06-05T13:30:00+02:00 13:30 00:30 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-13-kollaborationsmodelle-fr-softwareentwicklung-an-der-hu https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/HDSNMP true Institutional RSE Communities II (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Der Computer- und Medienservice ist der zentrale IT-Dienstleister der Humboldt-Universität zu Berlin. Der Vortrag skizziert anhand von Beispielen unterschiedlichen Kooperationsmodelle und möchte im Anschluss diskutieren, wie dies bei anderen Einrichtungen gehandhabt wird. Malte Dreyer 2019-06-05T14:00:00+02:00 14:00 00:30 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-50-empfehlungen-fr-bessere-forschungssoftware https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/KASRSJ false Institutional RSE Communities II (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Im DLR wird eine Vielzahl von Software entwickelt. Die Software-Entwickelnden sind häufig Domänenexperten und verfügen über keine spezielle Ausbildung in diesem Bereich. Zu deren Unterstützung hat das DLR einen Katalog von Empfehlungen in Bezug auf gute Software-Entwicklungs- und Dokumentationspraxis entwickelt. Zur leichteren Nutzung des Katalogs existiert ein einfaches Klassifikationsschema und es werden Checklisten in unterschiedlichen Formaten bereitgestellt. In diesem Vortrag stellen wir die Empfehlungen und das Klassifikationsschema anhand von Beispielen vor. Zudem gehen wir auf erforderliche Unterstützungsangebote ein, damit Software-Entwickelnde die Empfehlungen effektiv umsetzen können. Tobias Schlauch 2019-06-05T14:30:00+02:00 14:30 00:30 Haus A45 Süd: Hörsaal derse19-123-zwischen-digital-und-humanities https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/YUY3FT false Institutional RSE Communities II (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Die digitalen Geisteswissenschaften an der Berlin-Brandenburgischen Akademie der Wissenschaften werden dieses Jahr volljährig. Seit 2001 betreut TELOTA dort Projekte zu Digital Humanities, Softwareentwicklung und Forschungsdatensicherung. Die Herausforderungen als Team von ForschungssoftwareentwicklerInnen in den digitalen Geisteswissenschaften sind vielseitig. Pflege von Legacy-Software mit minimalen Budget, Vermittlung zwischen komplexen geisteswissenschaftlichen Sachverhalten und nachnutzbaren Datenstrukturen, sowie die Umsetzung von Best Practices aus dem DH-Bereich. Dieser Vortrag soll über die Dualität der Rolle als ForschungssoftwareentwicklerIn in den digitalen Geisteswissenschaften berichten: zwischen Digital und Humanties. Oliver Pohl, Andrea Notroff 2019-06-05T11:00:00+02:00 11:00 04:00 Haus A45 Süd: Konferenzraum derse19-34-herausforderungen-fr-die-nachhaltige-entwicklung-bereitstellung-und-pflege-von-forschungssoftware-in-deutschland https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/PVEXDH false Workshops Workshop inkl Mittagspause (240 Min) de None Während viele Fragestellungen der Nachhaltigkeit von Forschungssoftware weltweit ähnlich sind, müssen insbesondere finanzielle, rechtliche und organisatorische Herausforderungen im nationalen Kontext betrachtet werden. Dazu gehören die Förderlandschaft, rechtliche Rahmenbedingungen, steuerrechtliche Fragen, vorhandene Infrastruktur und historisch gewachsene Aufgabenverteilungen. Wir möchten diese Fragen nach kurzem Einstieg interaktiv in Kleingruppen diskutieren. Die Ergebnisse sollen als Grundlage für ein White Paper "Nachhaltige Forschungssoftware in Deutschland" dienen. Weitere Schritte werden abschließend geplant. Der Workshop steht in Zusammenhang mit einer geplanten Podiumsdiskussion zum Thema, die inhaltliche Impulse geben soll. Axel LoeweMatthias KaterbowStephan DruskatGunnar SeemannFelix Bach 2019-06-05T15:30:00+02:00 15:30 01:30 Haus A45 Süd: Konferenzraum derse19-110-rse4nfdi-nachhaltigkeit-von-forschungssoftware-in-der-nationalen-forschungsdateninfrastruktur-nfdi-deutschland https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/GGVMDV true Splittertreffen Splittertreffen de None Die nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) soll die Datenbestände von Wissenschaft und Forschung systematisch erschließen, nachhaltig sichern und zugänglich machen sowie vernetzen. Ein Querschnittthema über alle Konsortien hinweg ist die notwendige Berücksichtigung und Integration sowie das Treffen von Maßnahmen für einen nachhaltigen Umgang und Einsatz von Forschungssoftware in der NFDI. Das Thema Forschungssoftware soll deshalb übergreifend in einem zukünftigen Konsortium namens RSE4NFDI verankert werden. In dem Splinter-Meeting sprechen potentielle Partner dieses Konsortiums über das weitere Vorgehen und die konkrete Gestaltung eines Antrags für die Etablierung von RSE4NFDI. Martin HammitzschDaniel NüstFrank Löffler 2019-06-05T11:00:00+02:00 11:00 01:30 Haus A31: Westflügel derse19-67-fair-software https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/S8T8HW true Birds of a feather (BoF) informelle Gesprächsrunde (BoF) en None The FAIR Principles advocate that all scientific resources should be findable (F), accessible (A), interoperable (I) and reusable (R). First formally published in 2016, they quickly had an amazing impact on the eScience community. Interestingly, although not limited to that, so far the attention has mainly been on the application of the FAIR principles to scientific data. Meanwhile the discussion in the eScience community has reached software as the second major "ingredient" of computational science: What exactly do the FAIR principles mean for (scientific) software? And how can we as a community support researchers and developers in making their software FAIR? We share first insights and invite deRSE19 participants to join the discussion. Anna-Lena LamprechtCarlos Martinez 2019-06-05T13:30:00+02:00 13:30 01:30 Haus A31: Westflügel derse19-82-gitlab-selbst-betreiben-wie-sind-die-erfahrungen-wie-ermglichen-wir-kooperation-mit-externen- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/WUCYDR false Birds of a feather (BoF) informelle Gesprächsrunde (BoF) de None Es gibt viele gute Gründe, warum akademische Einrichtungen eine eigene GitLab-Instanz betreiben. Welcher Grad der Dezentralisierung dabei sinnvoll ist, können wir diskutieren. Ein Beispiel: Die Universitätsbibliothek Bielefeld betreibt seit 2013 eine GitLab-Instanz. Jetzt wird diese uni-weit ausgerollt. Und schon wird diskutiert, ob es ein zentrales GitLab für die Hochschulen in NRW geben soll. Oder vielleicht sogar bundesweit? Ein Argument für zentrale Instanzen waren bisher die Pull Requests (GitHub) bzw. Merge Requests (GitLab), die auch Fremden die Mitarbeit an Projekten ermöglichen, ohne dass der Projektbesitzer die Kontrolle verliert. Noch 2019 will GitLab dies auch über Instanzen hinweg ermöglichen. Weitere Themen: Lizenz, SSO Christian PietschFlorian Goth 2019-06-05T15:30:00+02:00 15:30 01:30 Haus A31: Westflügel derse19-19-anforderungen-wnsche-und-erfahrungen-fr-den-aufbau-des-hifis-competence-clusters-software-services-in-der-helmholtz-gemeinschaft https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/LQDSZW false Splittertreffen Splittertreffen de None Das HIFIS Cluster für Software Services unterstützt Mitarbeiter der Helmholtz-Zentren, die Forschungssoftware entwickeln. Im Splitter Meeting diskutieren die Teilnehmer, wie die Aufgaben konkret ausgestaltet werden können: 1) Training: Entwicklung des Lernprogramms, von Trainings, Hackathons und Online-Kursen sowie Erarbeitung abgestimmter Richtlinien und Empfehlungen zur Entwicklung von Forschungssoftware. 2) Technologie Services: Bereitstellung einer Infrastruktur, die die Planung, Entwicklung, Qualitätssicherung und die Auffindbarkeit der Software unterstützt. 3) Support Services: Etablierung von Anlaufstellen und Info-Plattformen für Support und Consulting. 4) Community Services: Schaffung von Austauschnetzwerken der Communities. Uwe Konrad 2019-06-05T08:30:00+02:00 08:30 00:30 Haus H: Foyer derse19-163-registration-get-in-coffee https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/GTGVNK false Pause en None Registration & Get-in Coffee deRSE19 Organizers 2019-06-05T10:30:00+02:00 10:30 00:30 Haus H: Foyer derse19-165-coffee-break https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/DNDRCK false Pause en None Coffee Break deRSE19 Organizers 2019-06-05T12:30:00+02:00 12:30 01:00 Haus H: Foyer derse19-166-lunch https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/MT3YBU false Pause en None Lunch deRSE19 Organizers 2019-06-05T15:00:00+02:00 15:00 00:30 Haus H: Foyer derse19-167-coffee-break https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/JQPKPW false Pause en None Coffee Break deRSE19 Organizers 2019-06-05T18:15:00+02:00 18:15 01:00 Haus H: Foyer derse19-149-poster-session-drinks-reception-geo-bof https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/7E8MEA false Poster Postersession en None After the posters have been presented in a session of lightning talks, we commence the poster session proper. Mixing (net)work(ing) & play, it coincides with the drinks reception, sponsored by Amazon Web Services. The Geo BoF event will also take place during the drinks reception, run by Daniel Nüst (University of Münster) and Martin Hammitzsch (GFZ Potsdam): "'Geo' is an important aspect in more and more scientific disciplines, tools and reasearch software. From remote sensing imagery to geotagged photos, geospatial and temporal properties are everywhere. But so are the challenges of working with large datasets and geographic projections. In this informal BoF session, you can meet fellow OSGeo fans and geo-enthusiasts to share recent struggles and experiences." deRSE19 Organizers 2019-06-05T19:15:00+02:00 19:15 02:00 Haus H: Foyer derse19-175-drinks-reception-cont- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/EHWUZD false Social Event en None deRSE19 Organizers 2019-06-06T09:00:00+02:00 09:00 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-1-gui-architektur-fr-interaktive-datenanalyse https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/BEJ88P false User Interfaces (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None This talk will be held in German. Slides will be in English. For scientists, it is tempting to think of GUI development as a tedious but trivial task, best delegated to auxiliary personnel. Expect this approach to yield unstable software with unsatisfactory performance and an unmaintainable code base. Get a few basics right, and everything will be so much clearer and easier: Strictly separate the GUI layer from the scientific core. Dare using global variables to hold session and GUI state. Cache computational results. Ensure that the display is always up to date. Provide an emergency interrupt button. Foresee multithreading. Log user actions. Use a replay engine during development and for testing. Plan for scripting. Joachim Wuttke 2019-06-06T09:30:00+02:00 09:30 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-72-nicos-ein-steuerungsframework-fr-groforschungsgerte https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/8LTN8W false User Interfaces (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Unser Beitrag zeigt ein Framework, mit dem sich wissenschaftliche Experimente steuern lassen. Am MLZ stellen wir externen Gästen Instrumente zur Verfügung, um verschiedene wissenschaftliche Fragestellungen mit Neutronen zu untersuchen. NICOS bietet ein gemeinsames User-Interface und wiederverwendbare Komponenten, die die Techniken unterstützen. Es wird Python in einer stark angepassten Interpreterumgebung verwendet, um Abläufe zu steuern, Daten und Parameter zu visualisieren, in einer konfigurierbaren Schnittstelle. Auf Hardwareseite unterstützt NICOS die gängigen Middlewaretreiber und eine Plug-and-play-Philosophie mit eigenständigen embedded-Systemen. NICOS wird am MLZ verwendet, sowie am PSI in der Schweiz und der ESS in Schweden. Georg Brandl 2019-06-06T10:00:00+02:00 10:00 00:30 Haus H: Hörsaal derse19-69-umsetzung-effizienter-plattformunabhngiger-app-entwicklung-in-einer-bestehenden-forschungssoftware-landschaft https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/DFE7YK false User Interfaces (Sprache: Deutsch) Talk (30 Min) de None Zur Durchführung von Standschwingungsversuchen wird im Institut für Aeroelastik des Deutschen Zentrums für Luft- und Raumfahrt eine Sammlung verschiedener Softwaretools entwickelt. Diese dienen der effizienten Durchführung dieser Versuche und ermöglichen eine hohe Daten- und Ergebnisqualität. Die Nutzung mobiler Endgeräte ermöglicht es die Versuchsprozesse effizienter zu gestalten, da direkt am Versuchsobjekt ein Zugriff auf Daten realisiert werden kann. Daher wird eine neue App in die bestehende Softwarelandschaft integriert. Bei der Entwicklung stehen Plattformunabhängigkeit und eine effiziente Nutzung des bestehenden Codes im Vordergrund. Durch Nutzung von Xamarin konnte dieses Ziel und über 90% gemeinsamer Code erreicht werden. Ralf Buchbach 2019-06-06T11:00:00+02:00 11:00 01:30 Haus H: Hörsaal derse19-146-paneldiskussion-nachhaltigkeit-von-forschungssoftware-in-deutschland-in-german- https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/DS97LW false Sustainable long-living Software I (Sprache: Deutsch) Podiumsdiskussion de None Als Research Software Engineers sind wir verantwortlich dafür, Forschungssoftware nachhaltig zu entwickeln. Was aber sind die Voraussetzungen dafür, dass dies in der Praxis auch gelingt? Welchen Einfluss haben Aspekte der Bereitstellung und Pflege von Software? Welche Rolle spielen verschiedene Stakeholder an Forschungssoftware: Forschungsinstitutionen, Förderer, Bibliotheken, Repositories und Archive, Rechenzentren, Infrastrukturen, etc.? Was sind Aspekte von Nachhaltigkeit, allgemein und spezifisch für die deutsche Forschungslandschaft? Nach einem kurzen Impulsvortrag aus dem deRSE19-Workshop [Herausforderungen für die nachhaltige Entwicklung, Bereitstellung und Pflege von Forschungssoftware in Deutschland](https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/PVEXDH/) diskutieren wir diese und andere Fragen mit dem Expertenpanel: - Matthias Katerbow (Deutsche Forschungsgemeinschaft) - Anna-Lena Lamprecht (Universiteit Utrecht) - Katrin Leinweber (Technische Informationsbibliothek Hannover) - Michael Meinel (Deutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt) - Andeas Zeller (CISPA, Universität des Saarlandes) Um die Diskussion für das Publikum zu öffnen, haben alle Anwesenden im Anschluss an die Eingangsdiskussion die Möglichkeit, dem Panel direkt Fragen zu stellen. Dies geschieht unter Zuhilfenahme der [Slido App](https://www.sli.do/), die auch das Priorisieren von Fragen per Live-Voting erlaubt. Die Diskussion wird moderiert von Carina Haupt (Deutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt) und Stephan Druskat (Deutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt, Friedrich-Schiller-Universität Jena). deRSE19 Organizers 2019-06-06T13:30:00+02:00 13:30 01:15 Haus H: Hörsaal derse19-143-closing-session https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/WGEJMA false Keynotes Closing Session en None tba deRSE19 Organizers 2019-06-06T09:00:00+02:00 09:00 00:20 Haus A56: Konferenzsaal derse19-85-the-research-software-engineering-landscape-in-germany https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/9WDH39 false Communication and Outreach (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None The SSI conducted yearly RSE surveys in the year 2017 and 2018. The survey was transported to Germany by Martin Hammitzsch and Stephan Janosch. Both surveys received over 300 answers each and deserve a proper analysis. Especially the many questions and their answers gave helpful insight how the German RSE landscape looks like. Includes scary and positive facts. Stephan JanoschMartin Hammitzsch 2019-06-06T09:20:00+02:00 09:20 00:20 Haus A56: Konferenzsaal derse19-78-rse-2-0 https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/NJSQBN false Communication and Outreach (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Research Software Engineering is gaining in recognition as both a discipline and a career thanks to established bodies such as the SSI and newer initiatives including deRSE. But what does the future hold as RSE groups mature, research becomes increasing data-driven and the practice of software engineering evolves ever-more rapidly? This talk considers potentially disruptive developments in technology that RSEs may need to embrace to play a ongoing role in keeping their institutions at the forefront of research: from machine learning and “Software 2.0” to serverless deployments. I hope this will inspire discussion within the community regarding the future of Research Software Engineering and how we prepare ourselves for it. Mark Woodbridge 2019-06-06T09:40:00+02:00 09:40 00:20 Haus A56: Konferenzsaal derse19-63-research-software-network-for-the-digital-humanities-forschungssoftware-netzwerk-fr-die-digital-arbeitende-geistes-und-kulturwissenschaftlerinnen https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/PHNATV true Communication and Outreach (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Sustainable operation, maintenance and development of software, which is utilized in various areas of a research infrastructure and used in various disciplines of the digital humanities (DH), is one of the most serious and important challenges faced. In order to align work on research software development with other DH infrastructures and to unify the recommendations for developers and operators of DH research software, the EURISE network was established. EURISE stands for European Research Infrastructure Software Engineers' Network and the purpose of this international collaboration is to harmonize technical recommendations and processes in research software engineering (RSE). Tibor Kálmán 2019-06-06T10:00:00+02:00 10:00 00:20 Haus A56: Konferenzsaal derse19-66-development-of-research-software-at-dlr-role-and-status-in-practice https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/MQCZ3N false Communication and Outreach (Sprache: Englisch) Talk (20 Min) en None Software is an important innovation factor and an integral part of modern research. As a consequence the development of software becomes more and more the norm in research alongside the mere use of software. In an effort to obtain an overview of the current practice of research software development at DLR and to optimize our existing support activities for software developers at DLR, we conducted a DLR-wide survey on research software at the end of 2018. The answers of the approximately 770 participants provide a comprehensive picture of the current state of practice. In this presentation we want to give an insight into the heterogeneous landscape of the research software development of a large distri Lynn von Kurnatowski 2019-06-06T15:15:00+02:00 15:15 02:15 Haus A56: Konferenzsaal derse19-145-de-rse-e-v-jahreshauptversammlung https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/XULCA3 true de-RSE Jahreshauptversammlung de-RSE Jahreshauptversammlung en None tba deRSE19 Organizers 2019-06-06T09:00:00+02:00 09:00 03:30 Haus A31: Große Kuppel derse19-129-entwicklung-von-policies-und-richtlinien-fr-forschungssoftware https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/KZX8VD true Workshops Workshop inkl Kaffeepause (210 Min) de None Die Bedeutung von Software für den Forschungsprozess wird immer deutlicher. Damit rückt auch der Prozess der Entwicklung von Forschungssoftware in den Fokus, der neben technischen Aspekten auch eine Reihe von rechtlichen und organisatorischen Fragen, sowie Herausforderungen der Karriereenwicklung berührt. Die Schwerpunktinitiative „Digitale Information“ der Allianz der deutschen Wissenschaftsorganisationen und die Helmholtz-Gemeinschaft arbeiten dazu an Richtlinien. In diesem interaktiven Workshop stellen wir den Stand dieser Überlegungen vor und laden Euch ein, Eure Erfahrungen einzubringen. Damit könnt Ihr Einfluss auf die Inhalte dieser Richtlinien nehmen. Kaja ScheligaJürgen FuhrmannBernadette FritzschTobias Schlauch 2019-06-06T09:00:00+02:00 09:00 01:30 Haus A45 Süd: Konferenzraum derse19-27-organisation-von-lokalen-und-regionalen-rse-chapters-organising-rse-chapters https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/CH7TTH true Birds of a feather (BoF) informelle Gesprächsrunde (BoF) de None [Non-German speakers welcome!] Eine Diskussionsrunde Rund um das Thema lokale und regionale RSE-Gruppen, sogenannte Chapter. Wir möchten miteinander diskutieren, wie lokale RSE Chapter funktionieren können und was der Verein tun kann um sie zu unterstützen. Erste Erfahrungen aus München und Münster sowie die Ergebnisse der RSE-Umfrage werden uns helfen, das Gespräch zu starten. Daniel NüstHeidi Seibold 2019-06-06T11:00:00+02:00 11:00 01:30 Haus A45 Süd: Konferenzraum derse19-127-organisations-und-projektmanagementmetoden-in-forschungssoftwareentwicklungsprojekten https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/3NMQJM true Birds of a feather (BoF) informelle Gesprächsrunde (BoF) de None Die Entwicklung von Forschungssoftware unterliegt anderen Rahmenbedingungen als kommerzielle Software. Das betrifft neben Finanzierung und Zielgruppen vor allem den Entwicklungskontext und die Projektzusammenstellung. Dazu kommt, dass RSEs eine Schnittstellenkompetenz in sich vereinen müssen, die in den einzelnen Fächern so bisher kaum ausgebildet wird. Diese Besonderheiten führen dazu, dass die aus der agilen Softwareentwicklung bekannten Organisations- und Projektmanagementmetoden nur eingeschränkt funktionieren. In informeller Runde soll diskutiert werden, welche Erfahrungen die Teilnehmer innerhalb ihrer Projekte gemacht haben, welche Methoden erfolgreich eingesetzt wurden, wo Verbesserungsbedarf besteht und wie man diesen umsetzen kann Alexander Czmiel 2019-06-06T11:00:00+02:00 11:00 01:30 Haus A31: Westflügel derse19-136-cost-effective-research-leveraging-aws-spot https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/J7RUXT false Workshops Workshop en None With Amazon Web Services (AWS), you can spin up EC2 compute capacity on demand with no upfront commitments. You can do this even more cost effectively by using Amazon EC2 Spot Instances to bid on spare Amazon EC2 computing capacity. This allows users to get 90% off on demand prices (often as little as 1c per core hour) and has helped them run very large scale workloads cost effectively. For example, at USC a computational chemist spun up 156,000 core in three days. Also, with the recent release of the Spot fleet API, a researcher or scientist can easily have access to some of the most cost effective compute capacity at a very large scale. Learn how to effectively use these tools for your research needs. Ralph Winzinger 2019-06-06T08:30:00+02:00 08:30 00:30 Haus H: Foyer derse19-168-get-in-coffee https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/8MLRVR false Pause en None Get-in Coffee deRSE19 Organizers 2019-06-06T10:30:00+02:00 10:30 00:30 Haus H: Foyer derse19-169-coffee-break https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/NFVTDX false Pause en None Coffee Break deRSE19 Organizers 2019-06-06T11:00:00+02:00 11:00 01:30 Haus H: Foyer derse19-174--english-guided-tour-telegrafenberg-other-activities-invitation-only https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/EV3K9W false Social Event en None During the panel discussion on software sustainability in Germany - which is held in German - we offer English-speaking attendees a guided tour over the historic location of deRSE19. This tour will also include other activities (tba), and is available exclusively to non-German-speaking attendees, who will receive an invitation. deRSE19 Organizers 2019-06-06T12:30:00+02:00 12:30 01:00 Haus H: Foyer derse19-170-lunch https://derse19.uni-jena.de/derse19/talk/DDPMS9 false Pause en None Lunch deRSE19 Organizers